1. 藥庫存量管理
藥庫目前編制，一名管理藥師及三名助理共計四員。業務內容包括：藥品驗收及供應、存量管制、庫存規劃、不良瑕疵品處理、退換貨，各項作業本部皆訂有標準作業規範及品管措施，藥品供應正常及品質要求亦是確保用藥安全、有效之要件之一。
2. 藥品效期管理
效期管理部分，每兩個月由資訊部自動出表，交由藥師全面查核藥品有效期限，並要求所有藥品均須做到先進先出，避免發生藥品過期事件，同時利用此一機制，檢討耗用庫存、避免滯料與成本控制，讓資源得到最好之利用。
成立藥品管理組，專責藥品使用管理與各項藥事品管，以提供一個更好的藥事服務品質。
3. 藥事品質管制作業
i. 本院自民國93年設立『處方用藥審查小組』（Drug Utilization evaluation,簡稱 DUE），成員由專科主治醫師、護理部督導及藥師共同組成，例行性審查本院處方用藥之合理性與適當性，針對有疑義的處方案例討論，擬定改善對策，藉由系統管控避免再次處方錯誤。
ii. 本院藥劑部設有專責藥事品質管制作業的藥師一名，除負責例行品管指標之收集、檢討、呈核改善外，也負責防範 medication errors之相關教育訓練的教材、案例準備及人員訓練與評核。

4. 製劑品質管制作業
針對無藥廠生產但有臨床治療需要之藥品，藥劑部提供相關自製藥品，其製備作業皆訂有標準流程及品管作業規範，確保製劑品質，首先由專責藥師依據標準製備流程執行藥品配製，並由品管藥師依據製劑品管作業規範於製備前、中、後時段查核備藥與製備是否正確執行，且製備與查核內容均需確實紀錄於製劑品管單，以確保用藥安全。
5. 管制藥品管理
i. 本院設有管制藥品管理委員會，負責制定管制藥品管理標準作業規範，有效管理醫事人員安全與正確使用管制藥品。同時藥劑部設有管制藥品管理藥師1名，負責審核使用單位之麻醉藥品交換與配發，每月並派藥師到各單位查核麻醉藥品之管理情形。
ii. 定期舉辦管制藥品相關教育訓練，以確保人員熟悉相關作業規範。
iii. 處方醫令系統管控須有管制藥品使用執照之醫師方可開立管制藥品，同時亦加強管制藥品開立相關管控，以確保管制藥品正確使用與符合相關法令規定，維護病人用藥品質與安全。