糞便常規檢查
- 請病人將糞便解在乾淨的紙上。
- 用常規糞便盒之挖勺挖取約半隻大拇指量之糞便，放入常規糞便盒中，旋緊蓋子，然後送檢。
- 提醒病人勿以衛生紙包覆糞便檢體，以免影響檢驗結果。
糞便潛血化學法（Occult blood）
- 採集糞便檢體前三天禁食肉類、內臟、維他命C和鐵劑，以免影響檢驗結果。若醫師開立連續檢驗時，建議每日送檢，以維持檢體新鮮。
糞便潛血免疫定量法（Stool Hb）
- 請務必遵照「免疫定量法大便檢體採集步驟」說明操作。將採便管上藍色蓋子旋開，取出採樣棒水平置於糞便表面，來回刮取數次將凹槽填滿至少如米粒大小即可，慢慢小心將採檢棒插回並將上蓋旋緊。
阿米巴原蟲檢查（Amoeba examination）
- 請盡量於腹瀉時採檢，或盡量採集黏液部份，必要時可給予病人塑膠滴管以方便採取。
糞便培養（Stool culture）
- 糞便中含有黏液的部分最適合做微生物檢查。
- 糞便排出後直接裝入無菌容器內，亦可從直腸指診（Digital examination）時所用的手套取得糞便檢體。
- 使用藍色無菌運輸培養棒採檢時，請於排便後，直接以藍色無菌運輸培養棒之棉棒拭子擦拭肛門口採檢，然後將棉棒拭子放回無菌運輸培養棒後送檢。
- 直腸檢體需用一根浸過無菌生理食鹽水或液體輸送培養基之棉棒拭子插入肛門，輕輕旋轉，使之與直腸黏膜之表層接觸，然後取出置於含適當輸送培養基（Cary blairtransport medium、Culture swab、Buffered glycerol saline）之試管，並立即送檢。
- 採檢後儘速送至微生物組；若無法馬上送檢，請置於4°C冰箱冷藏保存，並儘速送檢。糞便或直腸拭子檢體作微生物檢查時，需特別注意輸送與接種的迅速性，如有拖延，可能有一些非病原性的腸內細菌因生長速度超過病原菌，而使病原菌之分離發生困難。
