本科因治療疾病對象涵蓋範圍廣闊，對於外科手術技巧與臨床判斷，有更高的要求，所以特別注重住院醫師養成訓練中，有關各種疾病的基本觀念、新知與不同治療方式之間差異性的探討，在科內部分，每週一有期刊研讀晨會，週三則為醫學書籍研讀晨會。此外，月底有合併症及死亡病例討論會，針對治療過程未盡完善的部分，探討與尋求精進的方法。
至於在跨科治療的領域，於月中有一般外科與急診聯合討論會，藉由科際之間的討論，讓急診病患的治療有一致的共識，以提升治療結果與病患滿意度。
此外，每個月有二至四次的消化系內外科、病理科聯合討論會，對於罕見、特殊與困難診治的個案，提出討論，對於年輕醫師在臨床治療上的學習有莫大的幫助。
癌症病患的治療，更是醫學中心的重要任務，本科目前針對大腸直腸癌、乳癌、胃癌、肝癌、胰臟癌均定期舉辦跨領域多專科團隊會議，從術前診斷、治療方式的選擇、癌症其別的判定、術後輔助治療等方面，集思廣益，以提高病人存活率與治癒率，讓住院醫師在參與會議的過程中，培養精準而正確的治療模式。
在本院受訓之實見習與PGY醫師，亦由專責之主治醫師帶領，學習對於外科常見疾病做個案討論、臨床照顧、影像及數據判讀，在適當可負擔的工作量下，做有效而確實的學習，以奠定未來行醫的良好基礎。
