傳統超音波的優點在於其方便性， 但是無法使用高頻率探頭，以致解相力偶感不足是其缺點，
腸氣及軟組織或骨頭的干擾更是其致命傷。內視鏡超音波(Endoscopic Ultrasound,
EUS)是利用內視鏡將超音波探頭送入腸胃道， 因此不受腸氣及軟組織或骨頭的影響，同時超音波探頭與受檢部位距離縮短，
可以使用頻率較高的探頭，解相力因而提高。 因此，一些使用傳統超音波不易檢查的部位例如食道，也可因內視鏡超音波的使用而在診斷上有重大的突破。
為便於敘述，可將內視鏡超音波依使用儀器的不同分成兩大類: 超音波內視鏡(Sonoendoscope)
及迷你超音波探頭 (mini-probe﹐或稱 EUS probe)。超音波內視鏡其內視鏡部份早期使用玻璃纖維，目前則改為電子式內視鏡，視角為略帶斜角側視型，其超音波掃瞄探頭的頻率為可互換的
7.5及 12 MHz。迷你超音波探頭其頻率為15或 20 MHz，可由傳統內視鏡的生檢腔放入。
由於多數腸胃科醫師已熟知傳統內視鏡超音波的適應症及優劣點，本文不再贅述，擬將重點置於討論超音波內視鏡的新進展及迷你超音波探頭的應用。
超音波內視鏡的新進展
1) Interventional Endoscopic Ultrasonography
(介入性內視鏡超音波) 主要利用配有工作腔(working channel) 的超音波內視鏡，藉著超音波的引導，使穿刺針或導管達到預期的部位，或利用工作腔做內視鏡方面的診斷或治工作。
a) EUS-guided FNA (fine needle aspiration): 此時須使用Curved
linear array的超音波內視鏡，才能於超音波掃瞄下看到穿刺針的前進。適用的對象為內視鏡超音波可以顯示但一般內視鏡無法做生檢的病變，例如胃黏膜下腫瘤、胰臟腫瘤或鄰近消化道的淋巴腺。
b) Celiac nerve block: 利用超音波可以辨認celiac trunk的特性，引導穿刺針對Celiac
nerve做Ethanol或Xylocaine的局部注射。通常用於控制胰臟癌或慢性胰臟炎的嚴重腹痛。
c) Endoscopic mucosal resection, EMR): 由於內視鏡超音波能準確的判定黏膜腫瘤的範圍及侵犯深度，可以選擇適合以EMR治療的早期胃癌、食道癌。
d) Pseudocyst drainage: 利用內視鏡做pancreatic pseudocyst的胃/腸內引流時,
須借助內視鏡超音波判斷pseudocyst與胃/腸壁的距離以挑選適當的引流部位。但以往Radial
scan EUS無法直接看到穿刺針的前進，使用配備工作腔的Curved linear array超音波內視鏡，則可全程引導穿刺針進入pseudocyst。
a) EUS與Pan-endoscopy合而為一: 隨著超音波內視鏡的改進，前端的探頭部份體積縮小，而且可能變成radial
scan與linear scan可以互換，成為非常類似目前斜角的Pan-endoscopy。因此，一個不明原因的腹痛病患可以借助此種內視鏡，於一次檢查中以超音波掃瞄胰臟、膽囊及膽管，同時對食道、胃及十二指腸以內視鏡做徹底的觀察。屆時，內視鏡超音波將成為每個腸胃科醫師必備的技能。
b) ERSCP (ERCP + EUS): 一支超音波內視鏡兼具ERCP及EUS的功能，除了做ERCP外，更可做ENBD或EPT等治療性的工作。
c) EUS-guided FNI ( fine needle injection): 針對鄰近消化道的淋巴腺轉移病灶，注射化學治療藥物。
迷你超音波探頭
該探頭由於管徑細小，可由傳統內視鏡的生檢腔放入，而且使用較高的頻率，比起超音波內視鏡有以下的優點:
1) 適於微小病變尤其黏膜早期癌的檢查: 使用超音波內視鏡時，有時在尋找微小病變會有困難。使用迷你超音波探頭時，借助內視鏡的直接觀察再配合較高的頻率，對於早期癌的分期判定(staging)，準確性優於超音波內視鏡。
2) 阻塞性腫瘤(stenosing tumor)的檢查: 消化道腫瘤造成管腔狹窄時，超音波內視鏡常無法通過而造成不完整的檢查。迷你超音波探頭則可克服此種困擾。
3) 3-D影像: 將迷你超音波探頭置於膽管之管腔中，利用電腦形成3-D影像，可以顯示病變更完整的的輪廓。
雖然迷你超音波探頭有上述的優點，整體的實用性仍不如超音波內視鏡。因此，預算有限的醫院仍以先購買超音波內視鏡為宜。
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